出现尿道口流脓，伴有小便刺痛症状的原因，是感染导致尿路黏膜坏死、化脓所引起的，排尿时尿液刺激受损黏膜引起疼痛。但导致感染的致病菌有很多种，若流出的脓液无特殊气味，考虑为金黄色葡萄球菌，或者淋病奈瑟菌可能性大。若流出的脓液有明显的臭味，则考虑厌氧菌感染可能性大，但明确诊断还需要取脓液行细菌培养检查。另外，感染可能是单纯的泌尿系炎症，也可能是泌尿系肿瘤继发的细菌感染。所以对于高度怀疑为肿瘤继发感染的，需要行肿瘤标志物、泌尿系彩超、腹部CT、膀胱镜等相关检查以明确，避免延误治疗导致病情进一步进展。
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