巨细胞病毒性葡萄膜炎主要是表现为巨细胞病毒性视网膜炎。巨细胞病毒在免疫功能正常者，一般不引起疾病。而巨细胞病毒性视网膜炎，是获得性免疫缺陷综合症患者最常见的眼部表现，表现为散在的黄白色片状视网膜坏死、视网膜出血。因此检查主要是眼部的葡萄膜炎检查，包括眼底造影、眼底照相、眼压测量、眼前段检查以及血液学的检查，免疫功能、HIV抗体、巨细胞病毒抗体滴度、巨细胞尿液病毒检查。怀疑中枢神经系统受累时，进行颅脑CT和腰穿的检查、胸部检查。
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