肾结石的发病机制比较复杂，可以导致肾结石发病的原因也非常多，所以即使肾结石手术之后将结石完全取出，结石仍然可以再次复发。平时所说的一些对结石的预防的方法如多喝水、多活动等，只是能减少结石复发的几率，并不能完全的防止结石复发。尤其是一些特殊类型，特殊成分的结石如草酸钙结石，即使采取了相应的预防方法，仍然会复发。此外结石的出现还和体内的一些代谢性疾病有关，如甲状旁腺功能异常，在原发的疾病没有治疗之前，结石也都是随时可复发的。
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